A missão do OGMO é contribuir de forma decisiva na modernização do sistema portuário brasileiro, administrando a mão-de-obra do Trabalhador Portuário Avulso, sua prioridade maior, valorizando a experiência dos veteranos, treinando e qualificando os mais jovens, buscando permanentemente melhoria de qualidade de vida dos trabalhadores, garantindo mão-de-obra especializada a todos os usuários dos Portos Organizados do Rio de Janeiro, Itaguaí e Niterói.